Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

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Length 226 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cdkal1-202ENSMUST00000091674 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm44843-201ENSMUST00000208320 1396 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gpr33-201ENSMUST00000040161 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tefm-201ENSMUST00000050207 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gimap4-203ENSMUST00000118802 771 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm13595-201ENSMUST00000145994 494 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm3376-201ENSMUST00000180202 1143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1025-ps1-201ENSMUST00000188749 921 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm28140-201ENSMUST00000190148 1271 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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Ms4a4bQ9ES61 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Spcs1-206ENSMUST00000228736 702 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Gje1-201ENSMUST00000020016 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Olfr1188-202ENSMUST00000217131 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ms4a4bQ9ES61 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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