Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

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Length 1,070 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube3bQ9ES34 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube3bQ9ES34 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube3bQ9ES34 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ube3bQ9ES34 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ube3bQ9ES34 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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