Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Slc28a3Q9ERH8 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms