Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Clstn1Q9EPL2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
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Clstn1Q9EPL2 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Clstn1Q9EPL2 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Clstn1Q9EPL2 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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