Protein–RNA interactions for Protein: Q9DD06

Rarres2, Retinoic acid receptor responder protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres2Q9DD06 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Rarres2Q9DD06 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Rarres2Q9DD06 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms