Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Smg9Q9DB90 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms