Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Cldn34b2Q9D9N2 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Cldn34b2Q9D9N2 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms