Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Rnf138rt1Q9D9M9 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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Rnf138rt1Q9D9M9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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