Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Usp12Q9D9M2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Usp12Q9D9M2 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms