Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Ifi35Q9D8C4 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms