Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Chmp5Q9D7S9 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Chmp5Q9D7S9 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms