Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tmem54Q9D7S1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tmem54Q9D7S1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms