Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Chmp4cQ9D7F7 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chmp4cQ9D7F7 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Chmp4cQ9D7F7 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Chmp4cQ9D7F7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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