Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
PrameQ9D4Z5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PrameQ9D4Z5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PrameQ9D4Z5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
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