Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Ccdc83Q9D4V3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Ccdc83Q9D4V3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms