Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4B1

Sgms2, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgms2Q9D4B1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sgms2Q9D4B1 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms