Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Fndc8Q9D2H8 Tas1r2-201ENSMUST00000030510 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Fndc8Q9D2H8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms