Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Pramef12Q9D2F1 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pramef12Q9D2F1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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