Protein–RNA interactions for Protein: Q9D132

Upk1a, Uroplakin-1a, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1aQ9D132 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk1aQ9D132 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Upk1aQ9D132 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Upk1aQ9D132 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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