Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Gtf2e1Q9D0D5 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gtf2e1Q9D0D5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms