Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Cnih4Q9CX13 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms