Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Tdrd12Q9CWU0 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms