Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pard3bQ9CSB4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pard3bQ9CSB4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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