Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

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Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PompQ9CQT5 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PompQ9CQT5 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PompQ9CQT5 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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PompQ9CQT5 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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PompQ9CQT5 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PompQ9CQT5 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms