Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Smim8Q9CQQ0 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms