Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Commd4Q9CQ02 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Commd4Q9CQ02 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms