Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atg3Q9CPX6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Atg3Q9CPX6 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms