Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Mrpl27Q99N92 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms