Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rcbtb2Q99LJ7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4034-201ENSMUST00000187674 480 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Rcbtb2Q99LJ7 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms