Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Usp16Q99LG0 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Usp16Q99LG0 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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