Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ciao1Q99KN2 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ciao1Q99KN2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ciao1Q99KN2 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Ciao1Q99KN2 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ciao1Q99KN2 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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