Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm4950-201ENSMUST00000091905 618 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctu1Q99J10 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ctu1Q99J10 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms