Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Prpf6Q91YR7 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Prpf6Q91YR7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms