Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Celf2-225ENSMUST00000183091 2177 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atl3Q91YH5 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms