Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Dnajc28Q8VCE1 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Dnajc28Q8VCE1 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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