Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
GcaQ8VC88 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
GcaQ8VC88 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms