Protein–RNA interactions for Protein: Q8R361

Rab11fip5, Rab11 family-interacting protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip5Q8R361 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab11fip5Q8R361 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms