Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

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Length 856 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
MyripQ8K3I4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
MyripQ8K3I4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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