Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vrk3Q8K3G5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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