Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Lrrtm1Q8K377 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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