Protein–RNA interactions for Protein: Q8K129

Ctxn1, Cortexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctxn1Q8K129 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm28047-201ENSMUST00000184772 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
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Ctxn1Q8K129 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ctxn1Q8K129 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 237 ms