Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZQ2

Afg3l2, AFG3-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l2Q8JZQ2 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Afg3l2Q8JZQ2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Afg3l2Q8JZQ2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Afg3l2Q8JZQ2 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Afg3l2Q8JZQ2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms