Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab11fip3Q8CHD8 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rab11fip3Q8CHD8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rab11fip3Q8CHD8 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab11fip3Q8CHD8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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