Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Rbm28Q8CGC6 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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