Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx8Q8CFD4 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms