Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Nup88Q8CEC0 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Nup88Q8CEC0 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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