Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm18782-201ENSMUST00000209023 1399 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ufl1Q8CCJ3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ufl1Q8CCJ3 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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