Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Nhlrc3Q8CCH2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26872-201ENSMUST00000180862 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Nhlrc3Q8CCH2 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
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