Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
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Fbxo48Q8CAT8 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Fbxo48Q8CAT8 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms