Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.08□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Cnot2Q8C5L3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mpp4-204ENSMUST00000186477 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Cnot2Q8C5L3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms